Dentro de la Hacienda Mucuyché, se encuentran dos cenotes: Cenote Azul Maya y Cenote Carlota.
El cenote Carlota es de tipo semiabierto y con profundidades de hasta 7 metros. Este cenote debe su nombre a que en el año de 1865 la emperatriz de México, Carlota, en un viaje a la Península de Yucatán con destino a Campeche, llega a Mucuyché y se convierte en la primera persona en bañarse en sus aguas.
En tanto que el cenote Azul Maya, es un cenote de tipo caverna, al cual se llega a través del canal de agua que conecta ambos cenotes.